一、什么是消毒和灭菌
要了解消毒后养殖水体会发生什么变化得首先了解一下，什么是消毒和灭菌。
所谓的消毒是指：减少微生物的数量，使之达到安全或相对安全的水平，而与使用规定和使用目的相符合。
所谓的灭菌是指：杀灭或者不活化所有的微生物生命形式，它与消毒的区别在于灭菌的概念是绝对的。
所谓的消毒剂是指：能消除以细胞繁殖形态出现的微生物污染的化学试剂 。
水产养殖过程中一般使用的手段和产品是消毒和消毒药。
二、水产养殖中常用消毒药机理和特点
三、消毒后水体会发生什么变化
1、养殖水体的微生物总数降低：
消毒剂通过杀灭水体细菌和抑制水体细菌繁殖，控制水体细菌的数量，为养殖动物体质的恢复提供空间和时间同时提高机体的抗病力。对于养殖水体，当水体比较瘦或者气候不适合微生物繁殖生长的时候，水体微生物总数的降低同时也带来水体氮循环减弱的后果，可能会导致底部残饵等等有机物堆积。当水体比较肥或者气候适合微生物生长繁殖生长的时候，水色透明度等等指标会相对好转。
2、杀灭或抑制藻类：
使用后二氧化氯等等强氧化剂对幼藻类杀伤力很强，而氯、溴、碘等等分子量小、穿透性的卤族元素对各种不同阶段的藻会有比较大的伤害，甚至引起倒藻，有可能会导致缺氧或者养殖水体藻毒素短时间内大量增加等等其他意外。但是对于水太浓的池塘，使用氯、溴、碘等等分子量小、穿透性的卤族元素消毒药后，水色会表现比较清爽。
3、水体的氧化还原电位会发生变化：
在一些氨氮等有害气体含量较高的池塘，养殖水体的还原性物质一般会过多，当使用了二氧化氯、碘等等氧化性比较强的消毒剂后，会不同程度的提高了水体的氧化还原电位，降低氨、亚硝酸等含量，水质会有一定的改善。同时氧化性消毒剂在与水体还原性物质反应后，会降低了水体的耗氧量!